Капсула з Елен знайдена рятувальниками після багатьох років блукання у космосі. Їй повідомляють, що планета LV-426 колонізована, і їй доведеться повернутися туди, де розпочалося її пекло, тому що зв'язок із колоністами перервався. І ось у складі групи космічного десанту Ріплі вирушає на прокляту планету. Але тепер на людей там чекає не один Чужий, а тисячі. Хто зможе вижити у цій війні: чудовиська, здатні лише вбивати, або люди, здатні мислити?
Минуло 200 років після останньої сутички з чужим. Вченим вдалося воскресити загиблу Еллен Ріплі і відокремити з клітин її крові клітини Королеви Чужого. Корабель, на якому відбувалися експерименти, незабаром був захоплений контрабандистами. Вони перетворили базу в розплідник для створення чудовиськ. На кораблі, що прямує до Землі, почали відбуватися страшні речі, він заповнився огидними тваринами. Якщо вони потраплять на планету, то знищать все людство.
За сюжетом, лейтенант Ріплі зазнає аварії та змушена терміново посадити свій зореліт на якусь планету. Так вона потрапляє на планету Фіоріна-161, яка є в'язницею суворого режиму. Там утримують особливо небезпечних ув'язнених із зайвою Y-хромосомою - чоловіків, схильних до спалахів агресії та кримінальних дій. Невдовзі виявляється, що окрім хижих зеків, на планеті-в’язниці з’являється ще більш хижий ксеноморф, якого Ріплі привезла із собою...
